AlphaMissense 실데이터 연결됨 AlphaGenome API 연결됨 Gemini 연결됨
연동 안내 — 점수를 임의 생성하지 않습니다. 환경변수 ALPHAMISSENSE_DATA(TSV 경로) / ALPHAGENOME_API_KEY를 설정하면 실제 예측값이 자동 표시됩니다. 두 모델은 비상업 연구용 라이선스입니다.

AlphaMissense란

Overview
AlphaFold를 변이 빈도 데이터로 미세조정해 단백질 코딩 미스센스 변이(전체 게놈의 약 2%)의 병원성을 예측하는 모델입니다(Cheng et al., Science 2023). 변이를 양성 가능 / 불확실 / 병원성 가능으로 분류하며, ClinVar와 높은 일치를 보입니다. 최근에는 산전 진단(예: 초음파 이상 태아의 L1CAM 변이 병원성 신속 판정)에도 활용됩니다.
비코딩(98%) 조절 변이는 AlphaGenome(별도 아이템)이 담당합니다.

적재 현황 (실데이터)

Loaded
적재 변이
4,677,806
missense variants
유전자
314
genes
병원성
2,174,257
불확실
648,826
양성
1,854,723

변이 병원성 검색

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35개 유전자 미스센스 변이 (4,677,806개) 즉시 조회

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SOD2 — 4,218개 변이 (점수 높은 순, 50/85p)
변이병원성 확률분류3D
F128M 0.5422 불확실
D77E 0.5422 불확실
G36I 0.5419 불확실
N206M 0.5417 불확실
K114C 0.5414 불확실
G175A 0.5414 불확실
G126V 0.5411 불확실
P86E 0.5405 불확실
K89H 0.5404 불확실
Q143L 0.5400 불확실
Q160D 0.5394 불확실
R4M 0.5381 불확실
S52I 0.5375 불확실
A83C 0.5370 불확실
S127M 0.5365 불확실
D129C 0.5365 불확실
K122Y 0.5351 불확실
A138H 0.5341 불확실
G157W 0.5337 불확실
Q171D 0.5333 불확실
A83R 0.5322 불확실
V78S 0.5312 불확실
A57L 0.5308 불확실
N153L 0.5292 불확실
Q70F 0.5290 불확실
M1N 0.5278 불확실
Y69M 0.5277 불확실
A138Y 0.5276 불확실
E133R 0.5260 불확실
I208F 0.5251 불확실
V140F 0.5248 불확실
Q81S 0.5242 불확실
K202V 0.5235 불확실
E155M 0.5228 불확실
C164T 0.5227 불확실
Q160N 0.5226 불확실
P32M 0.5223 불확실
K221N 0.5218 불확실
K25N 0.5210 불확실
D34H 0.5206 불확실
S106I 0.5206 불확실
I46V 0.5202 불확실
L88F 0.5185 불확실
G141C 0.5184 불확실
E112H 0.5182 불확실
A203Q 0.5176 불확실
N91Y 0.5171 불확실
E112P 0.5165 불확실
K68L 0.5160 불확실
N153Q 0.5159 불확실

드라이버 변이 병원성

Variants
유전자변이 AlphaMissense병원성 확률 출처TCGA 빈도3D 구조
BRAF V600E 병원성 가능 0.993 AlphaMissense 실데이터 SKCM 53% 보기
KRAS G12D 병원성 가능 0.998 AlphaMissense 실데이터 PAAD 67% 보기
KRAS G12C 병원성 가능 0.998 AlphaMissense 실데이터 PAAD 67% 보기
KRAS G12V 병원성 가능 0.995 AlphaMissense 실데이터 PAAD 67% 보기
NRAS Q61K 병원성 가능 0.985 AlphaMissense 실데이터 SKCM 29% 보기
HRAS G12V 병원성 가능 0.995 AlphaMissense 실데이터 - 보기
TP53 R175H 병원성 가능 0.986 AlphaMissense 실데이터 PAAD 61% 보기
TP53 R248Q 병원성 가능 0.996 AlphaMissense 실데이터 PAAD 61% 보기
EGFR L858R 병원성 가능 0.997 AlphaMissense 실데이터 GBM 24% 보기
PIK3CA H1047R 불확실 0.538 AlphaMissense 실데이터 BRCA 34% 보기
IDH1 R132H 병원성 가능 0.992 AlphaMissense 실데이터 GBM 6% 보기
IDH2 R172K 병원성 가능 0.994 AlphaMissense 실데이터 - 보기
KIT D816V 병원성 가능 0.999 AlphaMissense 실데이터 - 보기
CTNNB1 S37F 병원성 가능 0.995 AlphaMissense 실데이터 - 보기

병원성 확률(0~1)은 실데이터 연동 시에만 표시됩니다. 현재 분류는 임상적으로 확립된 드라이버 기준(예시)이며 AlphaMissense도 동일하게 병원성으로 분류합니다.

산전 진단 연계

Prenatal
AlphaMissense는 초음파 이상 태아에서 발견된 미스센스 변이(예: L1CAM)의 병원성을 신속 판정해 산전 진단 워크플로를 가속한 사례가 보고되었습니다. 양수·융모막 확진검사 · 게놈 산전 종합 리포트와 연계됩니다.

실데이터 연동 방법

Setup
1. AlphaMissense 점수(비상업 연구용)를 받아 우리 유전자 서브셋 TSV로 변환:
gene  protein_variant  am_pathogenicity  am_class (탭 구분)
2. 환경변수 지정: ALPHAMISSENSE_DATA=/path/to/alphamissense_subset.tsv
3. 새로고침하면 위 표의 병원성 확률이 실제 값으로 자동 대체되고 출처가 "AlphaMissense 실데이터"로 표시됩니다.