AlphaMissense 실데이터 연결됨 AlphaGenome API 연결됨 Gemini 연결됨
연동 안내 — 점수를 임의 생성하지 않습니다. 환경변수 ALPHAMISSENSE_DATA(TSV 경로) / ALPHAGENOME_API_KEY를 설정하면 실제 예측값이 자동 표시됩니다. 두 모델은 비상업 연구용 라이선스입니다.

AlphaMissense란

Overview
AlphaFold를 변이 빈도 데이터로 미세조정해 단백질 코딩 미스센스 변이(전체 게놈의 약 2%)의 병원성을 예측하는 모델입니다(Cheng et al., Science 2023). 변이를 양성 가능 / 불확실 / 병원성 가능으로 분류하며, ClinVar와 높은 일치를 보입니다. 최근에는 산전 진단(예: 초음파 이상 태아의 L1CAM 변이 병원성 신속 판정)에도 활용됩니다.
비코딩(98%) 조절 변이는 AlphaGenome(별도 아이템)이 담당합니다.

적재 현황 (실데이터)

Loaded
적재 변이
4,677,806
missense variants
유전자
314
genes
병원성
2,174,257
불확실
648,826
양성
1,854,723

변이 병원성 검색

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35개 유전자 미스센스 변이 (4,677,806개) 즉시 조회

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COMT — 5,149개 변이 (점수 높은 순, 55/103p)
변이병원성 확률분류3D
P227K 0.4058 불확실
Q175I 0.4058 불확실
A10D 0.4053 불확실
I261Q 0.4050 불확실
G52H 0.4040 불확실
A78E 0.4038 불확실
S236W 0.4033 불확실
Q170N 0.4033 불확실
K86A 0.4031 불확실
N71A 0.4029 불확실
K212I 0.4028 불확실
Q170D 0.4026 불확실
P199K 0.4026 불확실
C34H 0.4023 불확실
L16K 0.4022 불확실
R135V 0.4021 불확실
T214G 0.4020 불확실
L14E 0.4020 불확실
T242D 0.4014 불확실
H62Q 0.4004 불확실
Q57N 0.4002 불확실
I36S 0.4002 불확실
L24D 0.4001 불확실
G32H 0.3997 불확실
H232Q 0.3994 불확실
N61W 0.3993 불확실
P143M 0.3989 불확실
V111D 0.3987 불확실
R135Y 0.3981 불확실
L16H 0.3970 불확실
R135M 0.3969 불확실
A10N 0.3966 불확실
T54Y 0.3965 불확실
N61F 0.3965 불확실
H243W 0.3960 불확실
K161L 0.3952 불확실
R128M 0.3947 불확실
D171K 0.3945 불확실
G235W 0.3941 불확실
F41H 0.3940 불확실
I36R 0.3937 불확실
M90V 0.3933 불확실
C145I 0.3932 불확실
F247K 0.3931 불확실
D195K 0.3930 불확실
G133L 0.3928 불확실
K86L 0.3928 불확실
A147P 0.3926 불확실
I141Q 0.3924 불확실
A231C 0.3912 불확실

드라이버 변이 병원성

Variants
유전자변이 AlphaMissense병원성 확률 출처TCGA 빈도3D 구조
BRAF V600E 병원성 가능 0.993 AlphaMissense 실데이터 SKCM 53% 보기
KRAS G12D 병원성 가능 0.998 AlphaMissense 실데이터 PAAD 67% 보기
KRAS G12C 병원성 가능 0.998 AlphaMissense 실데이터 PAAD 67% 보기
KRAS G12V 병원성 가능 0.995 AlphaMissense 실데이터 PAAD 67% 보기
NRAS Q61K 병원성 가능 0.985 AlphaMissense 실데이터 SKCM 29% 보기
HRAS G12V 병원성 가능 0.995 AlphaMissense 실데이터 - 보기
TP53 R175H 병원성 가능 0.986 AlphaMissense 실데이터 PAAD 61% 보기
TP53 R248Q 병원성 가능 0.996 AlphaMissense 실데이터 PAAD 61% 보기
EGFR L858R 병원성 가능 0.997 AlphaMissense 실데이터 GBM 24% 보기
PIK3CA H1047R 불확실 0.538 AlphaMissense 실데이터 BRCA 34% 보기
IDH1 R132H 병원성 가능 0.992 AlphaMissense 실데이터 GBM 6% 보기
IDH2 R172K 병원성 가능 0.994 AlphaMissense 실데이터 - 보기
KIT D816V 병원성 가능 0.999 AlphaMissense 실데이터 - 보기
CTNNB1 S37F 병원성 가능 0.995 AlphaMissense 실데이터 - 보기

병원성 확률(0~1)은 실데이터 연동 시에만 표시됩니다. 현재 분류는 임상적으로 확립된 드라이버 기준(예시)이며 AlphaMissense도 동일하게 병원성으로 분류합니다.

산전 진단 연계

Prenatal
AlphaMissense는 초음파 이상 태아에서 발견된 미스센스 변이(예: L1CAM)의 병원성을 신속 판정해 산전 진단 워크플로를 가속한 사례가 보고되었습니다. 양수·융모막 확진검사 · 게놈 산전 종합 리포트와 연계됩니다.

실데이터 연동 방법

Setup
1. AlphaMissense 점수(비상업 연구용)를 받아 우리 유전자 서브셋 TSV로 변환:
gene  protein_variant  am_pathogenicity  am_class (탭 구분)
2. 환경변수 지정: ALPHAMISSENSE_DATA=/path/to/alphamissense_subset.tsv
3. 새로고침하면 위 표의 병원성 확률이 실제 값으로 자동 대체되고 출처가 "AlphaMissense 실데이터"로 표시됩니다.